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Por otra parte, se cree que la diversidad genética de los lobos ha estado en declive durante los últimos 200 años, y que la diversidad genética de los perros se ha reducido en la cría selectiva . Ello podría sesgar los análisis de ADN para apoyar una fecha de divergencia anterior. La evidencia genética de la domesticación evento que ocurre en el este de Asia también está sujeto a violaciónes de los supuestos.Estas conclusiones se basan en la ubicación de máxima divergencia genética , y asumir la hibridación no se produce, y que a las razas estando geográficamente localizada. A pesar de estos supuestos sostener para muchas especies, hay buenas razones para creer que no se aplican a los caninos.
Los análisis genéticos indican que todos los perros son probablemente descendientes de un puñado de acontecimientos de domesticación con un pequeño número de mujeres fundadoras, aunque no hay evidencia perros domesticados se cruzaron con las poblaciones locales de los lobos salvajes en varias ocasiones.Los datos sugieren primeros perros se separaron de los lobos en el este de Asia, y estos perros domesticados luego migraron rápidamente en todo el mundo, alcanzando el continente de América del Norte alrededor de 8000 AC. Los grupos más antiguos de perros, que muestran la mayor variabilidad genética y son los más similares a sus antepasados lobos, son principalmente las razas asiáticas y africanas, incluyendo el Basenji , Lhasa Apso , y Siberian Husky . Algunas razas que se consideran muy antiguo, como el Faraón Hound , perro ibicenco , y Elkhound noruego , ahora se sabe que Se han creado más recientemente.
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